Funktionelle Merkmale und ökologische Präferenzen von bodenbewohnenden Vampiramöben (Vampyrellida, Rhizaria) in einem Gradienten der Bewirtschaftungsintensität
Protisten sind ein wesentlicher Bestandteil der Bodenmikrobiota. Sie spielen verschiedene Rollen in Nahrungsnetzen und reagieren schnell auf Veränderungen der Umweltbedingungen. Sie können durch Sequenzierung in der Umwelt nachgewiesen werden, aber für fundierte Vorhersagen über ihre Effekte und Rollen benötigen wir detaillierte phänotypische und ökologische Daten. Die Vampiramöben sind eine große Ordnung freilebender Amöben, die sich speziell von anderen Eukaryoten ernähren. Sie wurden in den Böden der Biodiversitäts-Exploratorien in großer Zahl und Vielfalt nachgewiesen, aber ihre tatsächliche ökologische Rolle ist noch unbekannt.
Wir werden die vorhandenen Daten und DNA-Proben aus den Biodiversitätsexploratorien nutzen und die neuesten Long-Read-Sequenzierungstechniken von PacBio anwenden, um große Teile des ribosomalen Operons zu sequenzieren. Die daraus resultierenden qualitativ hochwertigen Sequenzen werden eine bessere phylogenetische Auflösung ermöglichen und die Phylogenie und das taxonomische System der Vampyrelliden revolutionieren.
Parallel dazu werden wir an frischen Bodenproben arbeiten, um neue Vampyrelliden-Taxa zu extrahieren und durch Lichtmikroskopie und Fütterungsversuche zu charakterisieren. Zusammen werden diese Daten zu einem wesentlich detaillierteren “öko-taxonomischen System” für die Zuordnung und Interpretation von Vampyrelliden-Sequenzdaten führen. Außerdem bilden sie die Grundlage für die Verfeinerung von Nahrungsnetzmodellen und die Prüfung der Auswirkungen der Bewirtschaftungsintensität auf terrestrische Vampyrelliden-Gemeinschaften.
Wissenschaftliche Mitarbeiter:innen
