#Mikroorganismen & Pilze #2011 – 2014
SOILFUNGI (Kernprojekt)
Langzeiterfassung ausgewählter Bodenpilze, räumliche und zeitliche Variabilität von Pilzgemeinschaften
Das zentrale Thema dieses Kernprojektes ist die Erfassung von der Diversität und den Gemeinschaftsstrukturen von Bodenpilzen, um die Beziehung zu den Ökosystemen Grasland und Wald, gebildet durch geographische und landschaftliche Gradienten, in allen drei Biodiversitäts-Exploratorien zu entschlüsseln (Fischer, Bossdorf et al. 2010).
1. Ausführliche Untersuchungen der Bodenpilz-Gemeinschaften entlang von Landnutzungsgradienten im Grasland und Wald der drei Biodiversitäts-Exploratorien auf allen EPs.
- Gewinnung von fundierten Kenntnissen über die Auswirkungen der geographischen Lage, regionaler mikro- und makroklimatischer Bedingungen sowie Landnutzungsintensität, Boden- und pflanzlicher Parameter auf die Diversität von Bodenpilzen
- Untersuchung und Separation zwischen potentieller Bodenmikroflora und der aktuellen aktiven Gemeinschaft
2. Untersuchung der räumlich-zeitlichen und biogeographischen Variationen der Bodenpilz-Diversität und Gemeinschaftsstruktur in kleinem Maßstab (siehe Projekt: SCALEMIC).
- Studie der Bodenpilzgemeinschaft auf regional-biogeographischer und mikro-biogeographischer Ebene zu unterschiedlichen Zeitpunkten
3. Untersuchungen der Veränderungen im bodenmikrobiellen Metagenom und/oder – Transkriptom im Vergleich von zwei Baumarten und zwei Zeitpunkten in ausgewählten Plots (siehe Projekt: SOILOMICS)
- Analyse struktureller und funktioneller Diversität und Variabilität zwischen den Plots
Basierend auf den Erfahrungen des ersten Durchlaufs werden sich in der zweiten Phase vorwiegend der neuesten Fortschritte der Next-Generation-Sequencing-Technologien bedient, die eine Analyse des großen Probenumfanges erlauben.
Scale-dependencies and determinants of soil microbial communities in forest ecosystems across the German Biodiversity Exploratories
Determinationen und Skalenabhängigkeiten mikrobieller Bodengemeinschaften in den Waldökosystemen der Deutschen Biodiversitätsexploratorien
Goldmann K. (2017): Scale-dependencies and determinants of soil microbial communities in forest ecosystems across the German Biodiversity Exploratories. Dissertation, Leipzig University
Unterschiedlich starke Habitatfilterung von Wurzel- und Bodenpilze in gemäßigten Buchenwäldern
Goldmann K., Schröter K., Pena R., Schöning I., Schrumpf M., Buscot F., Polle A., Wubet T. (2016): Divergent habitat filtering of root and soil fungal communities in temperate beech forests. Scientific Reports 6:31439. doi: 10.1038/srep31439
Mehr Informationen:
doi.org
Waldbewirtschaftung beeinflusst Diversität und Gemeinschaftszusammensetzung der Bodenpilze in gemäßigten Waldökosystemen
Goldmann K., Schöning I., Buscot F., Wubet T. (2015): Forest Management Type Influences Diversity and Community Composition of Soil Fungi across Temperate Forest Ecosystems. Frontiers in Microbiology 6:1300. doi: 10.3389/fmicb.2015.0130
Mehr Informationen:
doi.org
Wubet T., Christ S., Schöning I., Boch S., Gawlich M., Schnabel B., Fischer M., Buscot F. (2012): Differences in Soil Fungal Communities between European Beech ( Fagus sylvatica L.) Dominated Forests Are Related to Soil and Understory Vegetation. PLoS ONE 7(10): e47500. doi: 10.1371/journal.pone.0047500
Mehr Informationen:
doi.org
Öffentliche Datensätze
Buscot, Francois; Wubet, Tesfaye; Goldmann, Kezia (2018): Abundant fungi on all EPs (from Soil Sampling Campain 2011) - merged grassland and forest data: taxonomic look-up table. Version 3. Biodiversity Exploratories Information System. Dataset. https://www.bexis.uni-jena.de/ddm/data/Showdata/24306?version=3/ddm/data/Showdata/24306?version=3
Buscot, Francois; Wubet, Tesfaye; Goldmann, Kezia (2018): Abundant fungi on all EPs (from Soil Sampling Campain 2011) - merged grassland and forest data: relative abundance . Version 3. Biodiversity Exploratories Information System. Dataset. https://www.bexis.uni-jena.de/ddm/data/Showdata/24286?version=3/ddm/data/Showdata/24286?version=3
Buscot, Francois; Polle, Andrea; Wubet, Tesfaye; Pena, Rodica; Schröter, Kristina; Goldmann, Kezia (2018): Abundant forest fungi on all forest EPs (from Soil Sampling Campain 2011) - merged root and soil fungal data: relative abundance . Version 5. Biodiversity Exploratories Information System. Dataset. https://www.bexis.uni-jena.de/ddm/data/Showdata/23289?version=5/ddm/data/Showdata/23289?version=5
Buscot, Francois; Wubet, Tesfaye; Goldmann, Kezia (2018): Fungal assemblage from top soil at six dates in 2011 on one ALB grassland plot (SCALEMIC Experiment): OTU abundances. Version 3. Biodiversity Exploratories Information System. Dataset. https://www.bexis.uni-jena.de/ddm/data/Showdata/22906?version=3/ddm/data/Showdata/22906?version=3
Buscot, Francois; Polle, Andrea; Wubet, Tesfaye; Pena, Rodica; Schröter, Kristina; Goldmann, Kezia (2018): Abundant forest fungi on all forest EPs (from Soil Sampling Campain 2011) - merged root and soil fungal data: Presence/Absence . Version 4. Biodiversity Exploratories Information System. Dataset. https://www.bexis.uni-jena.de/ddm/data/Showdata/23288?version=4/ddm/data/Showdata/23288?version=4
Buscot, Francois; Polle, Andrea; Wubet, Tesfaye; Pena, Rodica; Schröter, Kristina; Goldmann, Kezia (2018): Abundant forest fungi on all forest EPs (from Soil Sampling Campain 2011) - merged root and soil fungal data: OTU taxonomic look-up table. Version 3. Biodiversity Exploratories Information System. Dataset. https://www.bexis.uni-jena.de/ddm/data/Showdata/23287?version=3/ddm/data/Showdata/23287?version=3
Buscot, Francois; Wubet, Tesfaye; Goldmann, Kezia; Klemmer, Sandra (2018): Abundance of arbuscular mycorrhiza fungi sampled from top soil at six dates in 2011 on one ALB grassland plot (SCALEMIC Experiment). Version 2. Biodiversity Exploratories Information System. Dataset. https://www.bexis.uni-jena.de/ddm/data/Showdata/22548?version=2/ddm/data/Showdata/22548?version=2
Buscot, Francois; Wubet, Tesfaye; Goldmann, Kezia (2018): Fungal assemblage from top soil at six dates in 2011 on one ALB grassland plot (SCALEMIC Experiment): OTU taxonomic look-up table. Version 2. Biodiversity Exploratories Information System. Dataset. https://www.bexis.uni-jena.de/ddm/data/Showdata/23006?version=2/ddm/data/Showdata/23006?version=2
Wubet, Tesfaye; Buscot, Francois; Goldmann, Kezia (2017): EP-Grassland abundant Soil fungi from Soil Sampling Campain 2011. Version 3. Biodiversity Exploratories Information System. Dataset. https://www.bexis.uni-jena.de/ddm/data/Showdata/21048?version=3/ddm/data/Showdata/21048?version=3
Wubet, Tesfaye; Buscot, Francois; Goldmann, Kezia (2017): EP-Forest abundant Soil fungi from Soil Sampling Campain 2011. Version 3. Biodiversity Exploratories Information System. Dataset. https://www.bexis.uni-jena.de/ddm/data/Showdata/21047?version=3/ddm/data/Showdata/21047?version=3
Buscot, Francois; Wubet, Tesfaye; Goldmann, Kezia (2016): Tree Distance Soil Fungi. Version 2. Biodiversity Exploratories Information System. Dataset. https://www.bexis.uni-jena.de/ddm/data/Showdata/19788?version=2/ddm/data/Showdata/19788?version=2
Wubet, Tesfaye; Klemmer, Sandra; Goldmann, Kezia; Buscot, Francois (2016): EP-Grassland-AMF-SoilCampain2011. Version 2. Biodiversity Exploratories Information System. Dataset. https://www.bexis.uni-jena.de/ddm/data/Showdata/19786?version=2/ddm/data/Showdata/19786?version=2
Goldmann, Kezia; Wubet, Tesfaye; Buscot, Francois (2013): Tree Distances and tree informations, 2012-2013. Version 2. Biodiversity Exploratories Information System. Dataset. https://www.bexis.uni-jena.de/ddm/data/Showdata/16286?version=2/ddm/data/Showdata/16286?version=2
Wubet, Tesfaye; Christ, Sabina; Buscot, Francois (2013): Fungal ITS pyrosequencing dataset - Forest VIP plots. Version 2. Biodiversity Exploratories Information System. Dataset. https://www.bexis.uni-jena.de/ddm/data/Showdata/15831?version=2/ddm/data/Showdata/15831?version=2
Nicht veröffentlichte Datensätze
Tree Distances Spruce HEW03 Nov, 2012
Goldmann, Kezia; Buscot, Francois (2013): Tree Distances Spruce HEW03 Nov, 2012. Version 2. Biodiversity Exploratories Information System. Dataset. https://www.bexis.uni-jena.de. Dataset ID= 15528
Tree Distances Beech HEW06 May, 2012
Goldmann, Kezia; Buscot, Francois (2013): Tree Distances Beech HEW06 May, 2012. Version 2. Biodiversity Exploratories Information System. Dataset. https://www.bexis.uni-jena.de. Dataset ID= 15527
Tree Distances Beech HEW06 Nov, 2012
Goldmann, Kezia; Buscot, Francois (2013): Tree Distances Beech HEW06 Nov, 2012. Version 2. Biodiversity Exploratories Information System. Dataset. https://www.bexis.uni-jena.de. Dataset ID= 15526
Tree Distances Spruce HEW03 May, 2012
Goldmann, Kezia; Buscot, Francois (2012): Tree Distances Spruce HEW03 May, 2012. Version 2. Biodiversity Exploratories Information System. Dataset. https://www.bexis.uni-jena.de. Dataset ID= 15326
Tree Distance additional Photos, 2013
Goldmann, Kezia; Buscot, Francois (2012): Tree Distance additional Photos, 2013. Version 2. Biodiversity Exploratories Information System. Dataset. https://www.bexis.uni-jena.de. Dataset ID= 14966
Die sogenannten Kernprojekte der BE gingen aus dem Projekt zur Flächenauswahl und dem Aufbau der Exploratorien (2006-2008) hervor. Sie stellen seit 2008 die Infrastruktur bereit und erheben für alle Projekte wichtige Basisinformationen zu Landnutzung, Diversität und Ökosystemprozessen (Langzeitmonitoring). Zudem sie koordinieren projektübergreifende Aktivitäten wie etwa verschiedene Grossexperimente.
Wissenschaftliche Mitarbeiter:innen
